玉溪温室大棚种植蔬菜**的缺点就是容易有病虫害。这是由于玉溪温室大棚内温度、湿度较大，空气流动缓慢，几乎不受外界直接影响造成的。对此，要做好以下工作：
1、尽量选择抗病品种，如辣椒有更新4号、更新5号、湘研9号辣椒、湘研10号辣椒、湘研11号辣椒、广椒2号、辣优4号,茄子有丰茄1号、丰茄2号,黄瓜有津杂三号黄瓜、津杂4号黄瓜、津春4号黄瓜,早青一代西葫芦等都是良好的保护地栽培品种。
2、做好土壤消毒。现在北方大棚已经进入了冬歇期，玉溪温室大棚蔬菜拔园后要做的主要工作就是准备土壤消毒。在下一次种植前，采取高温闷棚、或用生石灰撒在地面消毒、这样可有效的防治一些蔬菜的土传病害。
3、**每年深耕一次。
对于1-2年新建成的玉溪温室大棚，土传病害和盐渍化问题不突出，可以采取增施有机肥和生物菌肥，结合深翻地的措施。
定植时，可采用药剂穴施和蘸盘，如抗茬宁等蘸盘，穴施生物菌肥等，可大大减少烂根死棵现象。
3-5年的玉溪温室大棚，建议高温闷棚、结合氰胺化钙、棉隆等熏棚，同时结合嫁接和抗病品种。
减少化肥用量，增施有机肥，**进行轮作换茬或种植一茬绿肥作物(如苜蓿、**、玉米等)，必要时大水压盐。
5年以上的玉溪温室大棚，连作障碍有的已比较严重，尤其是10年左右的，常有黄叶、早衰、烂根、死棵现象，土层表面有白色或红色或绿色物质。
